Berechtigte Frage zu der ich nicht die Antwort weiß, bzw im Moment finde!
Meine Überlegung: Ich nehme an, dadurch, dass die meisten Klarträume nur Sekunden bis hin zu wenigen Minuten anhalten und meist wieder in Trübträume wechseln gibt es nicht allzu viele Bedenken.

Wie es bei den geübten Träumern ausschaut, die für längere Zeit (manche können angeblich sogar Stunden klarträumen) bei vollem Bewusstsein sind und ob es längerfristig schadet, wäre interessant zu wissen.
Vor allem ist die Ruhephase, bzw REM-Phase, ja total wichtig für das Festigen und Aussondieren von gewonnenen Informationen, aber wenn die Areale in denen das stattfindet wegen dem Klartraum den ganzen Schlaf über aktiv sind, ist das doch nicht möglich oder? Ich könnte mir gut vorstellen, dass es dadurch zu einer REM-Deprivation und wie du schon meintest dem Ausfallen dieser unbewussten Verarbeitung kommt. Andererseits holt das Gehirn normalerweise verpasste Prozesse nach, also gut möglich, dass diese Verarbeitung dann in den folgenden und normalen Nächten stattfindet.
Bin mir nicht sicher, ich schau mir das nochmal an.