고생이 많으시겠네요,
위에 말씀하신것은 위법사항은 아닌걸로 설명들은것 같네요....
탄력근무제 도입은, 업무를 집중해서 할 수 있는 시간이 개인별로 다르기 때문이죠
누구는 새벽에 일찍 와서 일하는것이 효율이 좋고
누구는 밤에 일하는게 효율이 좋고
결국 효율을 찾아 시간을 조정하는 방식이나, 관리 측면에서 어렵죠...

가장 좋은건 돈을 투자하는것인데
돈을 투자는 없고, 떄려맞추려고만 하니.. 52시간도... 분명 또다른 편법이 나오지 않을까
생각합니다.

자발적 근로라는 개념도 있고요 ( 입금 지불 안하는... 단 입증이 어려움)
잔업의 시간이 항상 업무 시간 이후가 아니다 라는 이야기도 있습니다. 예를들어 9to6이사면 저녁을 먹고 사람들이 쉬면 실제 잔업 시작은 6이 아니라는 것이져 6.5가 될 수도 있고.. 이런식으로 시작 시간을 조절하는 회사도 있습니다.

아무쪼록 잘 해결 하시기 바랍니다..