Конечно. Хоть Ctrl+A сделайте. Операция производится над выделенным фрагментом, а чем выделили - неважно.
Но обратите внимание на 2 момента - обязательно, для ровного края селекции, нужна растушевка (т.е.плавная граница зоны выделения, 3-5-10 пикселов), и 2-е: фрагмент лучше скопировать на новый слой - если этого не сделать, то при манипуляциях обязательно вылезет дырка в фоне :)
Удачных экспериментов!