Moinsen,

schau mal im IPFS-Repopfad unter datastore nach, ob dort eine MANIFEST-XXX liegt. Der Pfad ist der, welcher beim Initialisieren angezeigt wurde. Je nachdem, mit welchem OS du unterwegs bist, findest du den Pfad bei ~\.ipfs (also in Windows z.B. C:\Benutzer\BENAUTZERNAME\.ipfs).
Sollte dort eine Datei sein, die nicht so benannt ist, wie in der Fehlermeldung kannst du (auf eigene Gefahr) probieren, sie umzubennen. Da mir der Fehler bis eben nicht bekannt ist, weiß ich nicht, ob das hilft.
Wenn nicht, einfach den Ordner ./ipfs löschen und neu initialisieren.

BB,
JanSe